Henry William Brewer begyndte sin professionelle karriere i Tyskland, hvor han boede i flere år og gjorde sig bemærket ved at skildre middelalderlige bygninger. Hans tegninger imponerede med deres mesterlige opmærksomhed på detaljer og samspillet mellem lys og skygge. I Tyskland giftede han sig og stiftede en familie. Hans ældre børn blev født i Bayern. To af hans sønner blev senere også berømte som kunstnere og gravere. Hans ældste søn blev organist og forfatter.

Brower var uddannet som arkitekttegner i Norwich, England, under en af tidens mest fremtrædende arkitekttegnere. Ud over tegneundervisning deltog han dog også i kurser i oliemaleri og var studerende på King's College i London, hvor hans far var professor i litteratur. Efter sin hjemkomst fra Tyskland blev han kendt i England især for sine panoramamalerier og historiske rekonstruktioner. Hans tegninger blev offentliggjort i tidens vigtige arkitekturtidsskrifter. Brewer blev medlem af Royal Institute of British Architects. Fra 1858 udstillede han hyppigt på Royal Academy og på vigtige gallerier i London. Han er bedst kendt for en serie af London-visninger, der viser byen på Henrik VIII's tid, og som senere blev kendt som "Old London illustreret". Fugleperspektivbilleder af forskellige britiske byer var også særligt populære. Senere er der også blevet tilføjet visninger af byer på det europæiske fastland.

Også kongefamilien blev efterfølgende opmærksom på kunstneren, og Henry William Brewer modtog en række bestillinger fra den kongelige familie. Mest bemærkelsesværdigt var en bestilling fra dronning Victoria i 1869, for hvem han udførte en række akvareller af hendes kongelige mausoleum i Frogmore, hvor Albert, prinsgemalen og hun selv hvilede. Dronningen selv optræder på nogle af disse malerier.

Brewer og hans families omvendelse til den katolske kirke tiltrak sig stor opmærksomhed. Ligesom sin far tilhørte kunstneren Oxford-bevægelsen. Dette blev påvirket af den kendte franske arkitekt og kunstner Augustus Pugin, som selv var katolik. Hans dybtgående studier af religion og hans engagement i det katolske samfund har også påvirket hans arbejde, som omfatter et stort antal kirker i England, Tyskland, Ungarn og Belgien. Han er også kendt for at have malet akvareller i et katolsk præsteseminarium i England. Ud over sit kunstneriske arbejde underviste Brewer også i illustration på et college. Et særligt kursus var viet til fremstilling af perspektiver. Brewer døde i 1903. Mere end hundrede værker af Henry William Brewer befinder sig i dag på Victoria & Albert Museum i London. Den kongelige samling ejer også 26 af hans værker.